Почему NGS секвенаторы Геноскан становятся альтернативой Illumina

Секвенирование нового поколения (NGS) стало стандартом для геномных исследований, клинической генетики и молекулярной диагностики. В течение многих лет основными платформами на рынке оставались системы Illumina, однако в последние годы лаборатории всё чаще рассматривают альтернативные решения.
Одной из таких платформ стала линейка NGS-секвенаторов Геноскан, разработанная компанией Сесана и производимая в Российской Федерации.

Эти системы предназначены для выполнения широкого спектра задач геномики и молекулярной биологии:

• полногеномное секвенирование WGS;
• полноэкзомное секвенирование WES;
• RNA-seq;
• метагеномика;
• анализ микробиома;
• онкогенетические панели;
• генетическая диагностика.

При этом архитектура приборов и используемые протоколы позволяют лабораториям интегрировать оборудование в существующую инфраструктуру NGS-исследований.

Основная причина интереса к альтернативным NGS платформам

В последние годы лаборатории всё чаще обращают внимание на альтернативные технологии секвенирования по нескольким причинам.

Во-первых, важно снизить зависимость от одного производителя оборудования.
Во-вторых, для клинических лабораторий критически важна стабильность поставок расходных материалов.
В-третьих, растёт потребность в локальной сервисной поддержке и быстром обслуживании оборудования.

Секвенаторы Геноскан решают эти задачи благодаря локальному производству и инфраструктуре поддержки.

Российское производство NGS оборудования

Одним из ключевых преимуществ платформы Геноскан является производство оборудования на территории Российской Федерации.
Это дает лабораториям ряд практических преимуществ:

• стабильные поставки оборудования;
• доступность комплектующих;
• оперативный сервис;
• отсутствие санкционных рисков;
• поддержку производителя в России.

Для лабораторий, работающих в клинической диагностике, стабильность поставок реагентов и расходных материалов является критически важным фактором.

Совместимость с библиотеками Illumina

Одним из главных требований лабораторий при переходе на альтернативные NGS-платформы является совместимость с существующими протоколами подготовки библиотек.
Секвенаторы Геноскан поддерживают:

• протоколы TruSeq;
• протоколы Nextera;
• библиотеки Illumina.

Это позволяет лабораториям использовать уже существующие методики подготовки образцов и не менять текущие лабораторные процессы.
Кроме того, системы могут работать с реагентами российского производства Raissol, что дополнительно повышает доступность расходных материалов.

Сравнение NGS платформ Геноскан и Illumina



Важно понимать, что обе платформы используют схожие принципы секвенирования, поэтому лаборатории могут использовать схожие процессы.

Линейка секвенаторов Геноскан

Линейка оборудования включает несколько моделей, предназначенных для лабораторий различного масштаба.
На странице приведено краткое описание моделей, чтобы избежать дублирования информации с карточками оборудования.

Геноскан 3700 — настольный NGS-секвенатор для лабораторий со средним потоком образцов. Система подходит для таргетных панелей, микробиологических исследований, анализа микробиома и полноэкзомного секвенирования.
Модель применяется в научных лабораториях и центрах молекулярной генетики.
Подробнее о модели → /genoskan3700

Геноскан 4000 — высокопроизводительный секвенатор нового поколения, предназначенный для геномных исследований, RNA-seq и метагеномики.
Архитектура системы позволяет оптимизировать загрузку лаборатории при выполнении нескольких проектов одновременно.
Подробнее о модели → /genoskan4000

Геноскан 5000 — высокопроизводительная NGS-платформа для лабораторий с большим объемом геномных исследований.
Система применяется для масштабных проектов геномики, включая WGS, WES и транскриптомный анализ.
Подробнее о модели → /genoskan5000

Геноскан 6000 — ультра-производительная система секвенирования для крупных геномных центров.
Платформа используется для популяционных генетических исследований и масштабных проектов геномики.
Подробнее о модели →/genoskan6000

Когда лаборатории выбирают альтернативу Illumina

Переход на альтернативную платформу секвенирования чаще всего связан с несколькими факторами:

• необходимость технологической независимости;
• оптимизация стоимости исследований;
• локальная сервисная поддержка;
• стабильность поставок реагентов;
• расширение инфраструктуры NGS.

При этом многие лаборатории используют несколько платформ параллельно, что позволяет гибко распределять проекты.

Сервис и внедрение оборудования

При внедрении секвенаторов Геноскан лаборатории получают полный цикл сопровождения:

• подбор модели оборудования;
• подготовка коммерческого предложения;
• поставка оборудования;
• инсталляция системы;
• обучение персонала;
• методическая поддержка.

Наличие собственного сервисного центра позволяет обеспечить стабильную работу лаборатории.