Top.Mail.Ru
Оснащение
NGS-лабораторий
Секвенирование единичных клеток на платформах GeneMind с системой MobiDrop
MobiDrop — это комплекс приборов и реагентов для подготовки образцов к секвенированию единичных клеток (single cell sequencing). Платформа обеспечивает полный цикл работы — от ткани или клеточной суспензии до готовой библиотеки для секвенирования.

MobiNova®-D1 — система диссоциации тканей
Предназначена для стандартизированной механической диссоциации тканей с получением однородной клеточной суспензии.
Поддерживает предустановленные и пользовательские программы работы.

MobiNova®-100 — система захвата и баркодирования единичных клеток
Микрофлюидная система для генерации капель, в которых каждая клетка изолируется и получает уникальный молекулярный баркод.
Система подготовки single-cell библиотек MobiDrop
Портфель реагентов MobiDrop охватывает ключевые направления исследований на уровне единичных клеток:
  • транскриптом микроорганизмов;
  • экспрессию генов эукариотических клеток (3′ транскриптом);
  • иммунный репертуар и 5′ транскриптом;
  • эпигенетические модификации и связывание белков с ДНК.
Каждый набор ориентирован на конкретную биологическую задачу и может использоваться как самостоятельно, так и в составе комплексных проектов.

1) Реагенты для секвенирования транскриптома микроорганизмов

MobiMicrobe® High-throughput Single Cell RNA-seq Kit v1.0


Что исследуется:
  • экспрессия генов на уровне единичной бактериальной клетки;
  • различия между клетками внутри одной популяции;
  • наличие субпопуляций с разными метаболическими состояниями;
  • реакция микроорганизмов на антибиотики, стресс, изменения среды.
Зачем это нужно:
  • выявление устойчивых к антибиотикам клеток;
  • изучение гетерогенности бактериальных сообществ;
  • анализ микробиоты и промышленных штаммов;
  • исследование механизмов патогенности и адаптации.
Набор включает этапы фиксации клеток, повышения проницаемости клеточной стенки, внутриклеточной обратной транскрипции, добавления поли(A)-последовательности, генерации капель и построения библиотеки

2) Набор для секвенирования 3′ транскриптома эукариотических единичных клеток
MobiCube® High Throughput Single Cell 3' RNA-Seq Kit v2.1

Что исследуется:
  • уровень экспрессии генов в каждой клетке;
  • клеточные типы в ткани;
  • изменения экспрессии при заболевании;
  • клеточные состояния при развитии, воспалении, опухолевом процессе.
Зачем это нужно:
  • построение клеточной карты ткани;
  • выявление редких клеточных популяций;
  • изучение механизмов развития заболеваний;
  • анализ ответа на терапию.
3) Набор для анализа 5′ транскриптома и иммунного репертуара
MobiCube® High-Throughput Single Cell Immune Library V(D)J Kit v2.0

Что исследуется:
  • последовательности TCR и BCR на уровне единичной клетки;
  • разнообразие иммунного репертуара;
  • клональность лимфоцитов;
  • связь рецептора с транскриптомным профилем клетки.
Зачем это нужно:
  • исследование иммунного ответа при инфекции;
  • анализ опухолевой инфильтрации лимфоцитами;
  • разработка клеточных и антительных терапий;
  • мониторинг минимальной остаточной болезни;
  • изучение аутоиммунных заболеваний.
Процесс включает генерацию капель, обратную транскрипцию, амплификацию V(D)J и построение библиотек как иммунного репертуара, так и 5′ транскриптома.

4) Набор для анализа хроматин-связанных белков в единичных клетках
MobiCube® High-Throughput Single-Cell ChIP-seq Reagents v1.1

Что исследуется:
  • модификации гистонов (например, H3K27ac, H3K4me3 и др.);
  • распределение регуляторных белков по геному;
  • эпигенетические различия между клетками.
Зачем это нужно:
  • изучение регуляции экспрессии генов;
  • анализ эпигенетической гетерогенности опухоли;
  • исследование дифференцировки клеток;
  • поиск активных регуляторных элементов.
Этот набор позволяет связать эпигенетическое состояние клетки с её транскриптомным профилем в комплексных исследованиях.
Секвенаторы для запуска библиотек Mobidrop