NGS-технологии для коммерческих лабораторий – инвестиция в будущееКоммерческие генетические лаборатории стоят на переднем рубеже внедрения инноваций в практику. В последние годы все больше таких лабораторий обзаводятся собственными платформами секвенирования нового поколения, чтобы расширить спектр услуг и увеличить конкурентоспособность. NGS-секвенатор в частной лаборатории открывает сразу несколько направлений бизнеса: выполнение сложных диагностических тестов для медицинских клиник, секвенирование образцов на заказ для научных и промышленных организаций, участие в крупных проектах (например, скринингах населения) и др. Однако решение о покупке секвенатора – серьёзный шаг, требующий взвешенной оценки: какой объём услуг будет, окупится ли оборудование, хватит ли экспертизы персонала. В этой статье рассмотрим возможности, которые даёт NGS коммерческой лаборатории, и как их максимально эффективно реализовать.
Расширение диагностических услугОдно из ключевых применений NGS в коммерческом секторе – медицинские генетические тесты для клиник и индивидуальных клиентов. Сегодня спрос на такие услуги стремительно растёт: врачи всё чаще назначают генетические исследования для диагностики и выбора лечения, а здоровые люди заинтересованы узнать о своих генетических рисках.
Коммерческая лаборатория, имеющая NGS, может предлагать:
- Полноэкзомное секвенирование (WES) – анализ всех кодирующих областей генома пациента. Это востребовано при диагностике наследственных заболеваний, когда неизвестно, в каком гене искать мутацию. Лаборатория проводит секвенирование экзома и биоинформатический анализ, предоставляя клинике список выявленных вариантов. WES все активнее используется в медицине, и частные компании (например, Genomed, Инвитро и др.) уже оказывают такую услугу.
- NGS-панели генов – целенаправленные панели для определенных заболеваний. Например, панель онкогенетическая (десятки генов, мутации в которых ведут к наследственному раку), кардиогенетическая, панели для эпилепсии, иммунных нарушений и т.д. Разработав или приобретя такие панели, лаборатория может сотрудничать с узкопрофильными клиниками (онкологическими, кардиологическими), выполняя для их пациентов тесты.
- Новые тесты: НИПТ, фармакогенетика, метагеномика. NGS сделал реальностью неинвазивное пренатальное тестирование (НИПТ) – анализ ДНК плода по крови матери для выявления хромосомных аномалий. Коммерческие лаборатории массово внедрили НИПТ, и конкуренция идёт за счет точности и цены. Еще направление – фармакогенетические панели, определяющие варианты генов ферментов метаболизма лекарств: это помогает врачам подбирать дозировки (например, варфарина, антидепрессантов). Также некоторые лаборатории предлагают анализ микробиома человека (кишечника, кожи) – интерес частных лиц к таким тестам подогревается трендом на здоровый образ жизни. Все перечисленные тесты требуют NGS: либо глубокого секвенирования множества мишеней, либо массового анализа коротких фрагментов ДНК.
Наличие собственной платформы позволяет лаборатории контролировать качество и себестоимость, не отдавая эти дорогостоящие исследования на субподряд.
Статистика показывает, что рынок медицинских генетических тестов растёт двузначными темпами ежегодно. Лаборатории, инвестировавшие в NGS, получают преимущество: они могут расширить прайс-лист уникальными услугами, закрепить за собой лояльность врачей, ищущих где выполнить сложный анализ. Важно, что при наличии NGS возможно внедрять тесты оперативно по мере появления новых знаний. Например, идентифицирован новый ген, ассоциированный с болезнью – лаборатория добавила его в панель и остается лидером по полноте теста. Конечно, нужно вкладываться и в обучение врачей-партнеров, рекламировать новые возможности. В этом плане частные компании часто быстрее и гибче государственных центров, что и обусловило их успех в нише NGS-диагностики.
Секвенирование на заказ: сотрудничество с научными и индустриальными клиентамиПомимо медицинского сектора, коммерческая лаборатория может предоставить свои NGS-мощности
«в аренду» внешним заказчикам. Многие научно-исследовательские группы, особенно в университетах, не имеют собственного секвенатора – они обращаются в сервисные центры. Если лаборатория зарекомендует себя качеством, она может получать заказы на секвенирование от академических институтов: будь то секвенирование геномов штаммов микроорганизмов, RNA-Seq эксперименты, ампликон-16С для экологов и т.п.
Как правило, такие клиенты приходят по рекомендациям и ценят надежность и компетентность. Инвестиция в квалифицированный биоинформатический отдел тут критически важна – ученым нужен не просто сырой результат, а помощь в его получении и первичной обработке. Ряд коммерческих лабораторий в России уже успешно работают в этом сегменте, предлагая исследователям полный цикл – от выделения ДНК до дифференциальной экспрессии и визуализации данных.
Например,
Sesana как дистрибьютор оборудования также предоставляет научный сервис: на ее площадке выполняются демонстрационные и пилотные запуски NGS для вузов, рассматривающих покупку, либо в качестве услуги для компаний. С точки зрения бизнеса, подобное сотрудничество позволяет загружать секвенатор в периоды спада медицинских заказов и оптимизировать использование ресурсов.
Индустриальные клиенты – ещё один потенциальный сегмент. К примеру, агрохимические компании могут заказывать секвенирование генома новых селекционных линий растений или генотипирование (GBS) селекционного материала. Фармацевтические фирмы заинтересованы в секвенировании микробных штаммов-продуцентов антибиотиков. Компании пищевой промышленности – в метагеномном анализе заквасок или контроле загрязнений. Всех этих задач коммерческая лаборатория с NGS может взять на себя.
Особое внимание – сегмент клинических исследований фармкомпаний: сейчас практически каждое новое лекарство проходит фармакогенетическое сопровождение и молекулярное профилирование пациентов. Лаборатория, способная секвенировать панели генов или даже экзомы участников клинических исследований для фармкомпании, получает крупный заказ и укрепляет свою репутацию на рынке.
Окупаемость и выбор оборудованияКонечно, приобретение NGS-прибора – существенная статья расходов. Коммерческие лаборатории подходят прагматично: оборудование должно окупиться. Как посчитать окупаемость? Учитывается стоимость прибора (десятки миллионов рублей), расходных материалов на каждый запуск и потенциальный поток заказов. Например, небольшой секвенатор вроде Геноскан 3700 дешевле, но и выход данных у него мал – хорошо подойдёт для узкой ниши панелей, но не сделает экзомов в большом количестве.
Напротив, установка уровня Геноскан 4000 или Геноскан 5000 способна выполнить сотни экзомов или десятки геномов в месяц, но и должна иметь соответствующий загруз заказами.
Поэтому бизнесу важно спрогнозировать, какая услуга будет основной. Практика показывает, что медицинские тесты (НИПТ, экзомы, панели) – наиболее стабильный поток, разумеется при наличии рынка (клиник, врачей). Если лаборатория уже сотрудничает с медицинским сектором, NGS станет логичным расширением их предложений. Нередко лаборатории начинают с аутсорса: отправляют образцы на секвенирование партнёрам (в крупный центр или за рубеж), формируют спрос, нарабатывают экспертизу интерпретации, а затем принимают решение обзавестись своим прибором.
В России до недавнего времени многие заказы (особенно WES/WGS) выполнялись за границей (в Европе, Китае) из-за высокой стоимости своих секвенаторов и реагентов. Сейчас ситуация меняется: появились более доступные предложения на рынке.
Sesana предлагает исследовательским и коммерческим лабораториям альтернативные NGS-платформы с выгодными условиями – кроме GeneMind (китайского производства), также доступны, например, секвенаторы с РУ линейки «Геноскан».
Выигрыш состоит в снижении себестоимости анализа. Если реактив Illumina стоит условно X рублей на образец, а реактив GeneMind – в 1.5 раза дешевле, то при потоке в тысячи анализов экономия колоссальна. Плюс,
Sesana обеспечивает местный сервис, что важно для бесперебойной работы (доставка реагентов за 1-2 недели, свое обслуживание). Таким образом, частная лаборатория может быстрее окупить инвестицию и предлагать клиентам более низкие цены при той же марже.
Маркетинг и рост бизнеса с NGSВнедрив секвенатор, важно донести информацию до потенциальных клиентов. Маркетинговые усилия могут включать: образовательные мероприятия для врачей (что даёт экзом или НИПТ, когда назначать), презентации возможностей для научных институтов, кейсы успешных проектов (например, спасённый с помощью экзома ребёнок – очень сильный аргумент). Также стоит позиционировать себя как инновационный лидер: первая в регионе лаборатория с собственным NGS. Нередко это привлекает даже СМИ и дополнительный PR. Еще одна стратегия – партнерство: можно стать локальным представителем международных тестов. Например, если лаборатория не хочет сама разрабатывать панель, она может приобрести готовую у зарубежной компании и валидировать у себя. Часто западные компании ищут партнеров в странах, чтобы выйти на рынок, – наличие NGS делает лабораторию привлекательным партнером для таких случаев. Всё это ведёт к росту клиентской базы и, соответственно, увеличению загрузки приборов.
Для коммерческой генетической лаборатории освоение NGS – это шаг, требующий инвестиций, но при грамотном подходе окупающийся множеством возможностей. В условиях, когда медицина движется к персонализированным генетическим услугам, лабораториям выгодно быть теми, кто эти услуги предоставляет. Уже через несколько лет пациенты будут воспринимать анализ генома так же обычно, как биохимию крови, и лабораторный бизнес должен быть готов к этому спросу.
Сегодня вложения в NGS – это инвестиция в конкурентоспособность на ближайшие 5-10 лет. Тем более что на рынке доступны решения под разные бюджеты, а такие компании-партнеры, как
Sesana, помогают не только с оборудованием, но и с методологией, поддержкой, обучением персонала. Лаборатория, начавшая использовать секвенирование нового поколения, приобретает статус high-tech игрока, привлекает новых клиентов и может вырасти из локального сервиса в ведущий генетический центр региона. В конечном итоге выгоду получают все: и бизнес (новые источники дохода), и клиенты (точная диагностика, новые услуги), и наука с медициной в целом.