Top.Mail.Ru
Оснащение
NGS-лабораторий

современные возможности Секвенирования генома человека
с линейкой секвенаторов «Геноскан»

Современные отечественные технологические решения, включая линейку секвенаторов Геноскан, открывают возможности для независимой, устойчивой и высокопроизводительной генетической инфраструктуры в России.

Этапы полного геномного секвенирования

Стандартный процесс WGS (Whole Genome Sequencing) включает:
  1. Выделение высококачественной ДНК.
  2. Подготовка библиотек — фрагментация, очистка, лигирование адаптеров; используются реагенты российского производства Raissol.
  3. Секвенирование на платформе Геноскан — чтение фрагментов ДНК в высокопроизводительном режиме.
  4. Сборка и анализ данных — построение карты вариаций, поиск мутаций.
  5. Интерпретация результатов.
Эти этапы обеспечивают получение полного набора генетических вариантов для каждого исследуемого образца.

Линейка секвенаторов Геноскан

Системы Геноскан разработаны для широкого спектра задач — от исследований генома человека до микробиологии, онкологии и популяционной генетики.
Все устройства ориентированы на высокую производительность, точность и стабильность работы в клинических и научных лабораториях.

Геноскан 3700 — решение для высокоскоростного целевого анализа

Этот секвенатор предназначен для базовых задач, где требуется высокая точность и скорость, но не максимальный объём данных.

Особенности:
  • подходит для пилотных проектов WGS с умеренным покрытием;
  • оптимален для образовательных центров и небольших лабораторий;
  • обеспечивает стабильное качество чтений при работе с панелями, малым геномом и исследовательскими задачами.
Применение:
  • анализ отдельных генов;
  • первичная оценка геномных регионов;
  • исследования в условиях ограниченного ресурса.

Геноскан 4000 — инструмент для рутинных генетических исследований

Платформа высокой производительности, подходящая для большинства геномных проектов.

Возможности:
  • систематические WGS-исследования с 15–30× покрытием;
  • работа с популяционными выборками;
  • анализ генетического разнообразия и редких вариантов.
Преимущества:
  • высокая точность чтений;
  • стабильность при больших сериях образцов;
  • оптимальный баланс цена/производительность.

Геноскан 5000 — система секвенирования для решения объемных задач

Эта модель ориентирована на глубокое покрытие и высокочувствительную детекцию вариантов.

Преимущества:
  • высокая пропускная способность;
  • эффективное выявление SNV, indels, CNV и сложных вариаций;
  • возможность анализа опухолевых образцов с низкой долей мутантной ДНК.
Рекомендуемые сценарии:
  • наследственные заболевания;
  • онкологические панели;
  • транскриптомные исследования;
  • клинические WGS с глубоким покрытием.

Геноскан 6000 — флагманская система для крупных геномных проектов

Максимальная производительность линейки делает Геноскан 6000 платформой для крупномасштабных исследований и генетических инициатив.

Ключевые возможности:
  • высокопроизводительное WGS десятков и сотен образцов за один запуск;
  • работа с большими когорто-проектами;
  • применение в национальных генетических программах;
  • возможность построения референсных панелей вариаций.
Использование:
  • популяционная генетика;
  • геномные биобанки;
  • эпидемиологический надзор;
  • комбинированные проекты (геном + транскриптом + эпигеном).

Какие генетические вариации выявляются при WGS?

1. Точковые мутации (SNV)
Изменение одного нуклеотида — основная масса клинических вариантов.

2. Небольшие вставки и делеции (indels)

Часто лежат в основе наследственных синдромов.
3. Копийные вариации (CNV)

Изменения числа копий генов и крупных участков.
4. Структурные варианты (SV)
Инверсии, дупликации, транслокации.

5. Повторные последовательности
Особенно важны в неврогенетике (например, триплетные повторы).

Применение секвенирования генома человека

  • Клиническая генетикадиагностика редких наследственных заболеваний;
  • поиск вариантов неизвестного значения;
  • фармакогенетика;
  • пренатальная и неонатальная диагностика.
  • Онкология, поиск драйверных мутаций;
  • подбор таргетной терапии;
  • мониторинг опухолевого клона.
  • Популяционная генетикаоценка частоты аллелей;
  • анализ эволюционных процессов;
  • биобанкирование.
  • Персонализированная медицинаоценка индивидуальных рисков;
  • профилактические программы;
  • долгосрочное наблюдение.

Перспективы развития секвенирования в России

В ближайшие годы ключевые направления развития включают:
  • снижение стоимости WGS-анализа;
  • расширение отечественных платформ, включая систему секвенаторов Геноскан;
  • формирование национальных генетических референсов;
  • интеграцию клинических данных и мультиомики;
  • стандартизацию медицинской интерпретации геномных вариантов;
  • широкое внедрение реагентов российского производства Raissol в рутинные лабораторные процессы.

Полное геномное секвенирование является фундаментальной технологией современной медицины и генетики.
Линейка секвенаторов Геноскан 3700, 4000, 5000 и 6000 обеспечивает полный спектр возможностей — от малых исследовательских задач до национальных масштабных геномных программ, формируя устойчивую инфраструктуру для развития российской геномики.