ОСНАЩЕНИЕ И УСЛУГИ ДЛЯ НАУЧНЫХ ЛАБОРАТОРИЙ
Html code will be here
Как выбрать набор реагентов
для выделения ДНК и РНК:
5 ключевых критериев
Критерий 1. Тип и состояние исходного образца
Выбор набора для выделения ДНК или РНК всегда начинается с анализа исходного материала. Кровь, ткани, клетки, FFPE-блоки, мазки, микробные культуры, растения и фекалии принципиально отличаются по составу, уровню ингибиторов и степени деградации нуклеиновых кислот. Универсальных решений не существует, и попытка использовать один набор для всех типов образцов часто приводит к низкому выходу или плохой воспроизводимости.
Для работы с цельной кровью и плазмой оптимальны специализированные наборы, учитывающие наличие гемоглобина и других ингибиторов. В линейке реагенты российского производства Raissol представлены решения Blood и Blood Quick, рассчитанные на рутинные клинические и научные задачи, а также Blood Mito, ориентированный на выделение митохондриальной ДНК. Такие наборы обеспечивают стабильный выход и чистоту ДНК, пригодную для ПЦР и NGS.
Тканевые образцы требуют более жесткого лизиса и эффективного удаления белков и липидов. Для этого используются наборы Tissue и Tissue M. Первый вариант подходит для ручной работы со спин-колонками, второй — для магнитного метода и масштабируемых протоколов.
Для формалин-фиксированных и парафиновых образцов необходимы специализированные реагенты, так как стандартные протоколы не справляются с кросслинками и деградацией ДНК. Набор FFPE MAG учитывает эти особенности и позволяет получать ДНК, пригодную для амплификации и секвенирования.
Для микробиологических и аграрных лабораторий критичны наборы для бактерий, дрожжей, растений и сложных матриц. Реагенты российского производства Raissol включают решения для Microbe DNA, Plant DNA, Feces DNA и Bone DNA, что позволяет подобрать протокол под конкретную задачу без компромиссов по качеству.
Критерий 2. Метод выделения: спин-колонки или магнитные частицы
Второй ключевой фактор — технология экстракции. На практике используются два основных подхода: сорбция на кремниевых спин-колонках и сорбция на магнитных частицах. Каждый метод имеет свои сильные стороны и ограничения.
Спин-колонки остаются популярным решением для небольших объемов и ручной работы. Они не требуют дополнительного оборудования, легко осваиваются персоналом и подходят для лабораторий с невысокой загрузкой. Наборы Tissue, Blood и Microbe DNA относятся именно к этой категории. Их выбирают, когда важны простота, скорость и минимальные требования к оснащению.
Магнитные частицы обеспечивают большую гибкость. Они удобны при работе с большим количеством образцов, легко автоматизируются и снижают влияние человеческого фактора. Реагенты российского производства Raissol в формате Tissue M, FFPE MAG и Blood Mito позволяют выстраивать масштабируемые протоколы, совместимые с автоматическими станциями. Это особенно важно для диагностических центров и крупных научных лабораторий.
По сравнению с импортными аналогами Qiagen или Thermo Fisher, магнитные наборы отечественного производства выигрывают по доступности и стабильности поставок, при сопоставимых показателях чистоты и выхода нуклеиновых кислот.
Критерий 3. Качество, чистота и выход нуклеиновых кислот
Качество выделенной ДНК или РНК напрямую определяет успех последующих этапов анализа. Наличие ингибиторов, деградация или низкий выход приводят к провалам ПЦР, неравномерному покрытию при секвенировании и повторным переработкам образцов.
При выборе набора необходимо учитывать несколько параметров: соотношение A260/280, отсутствие белковых и солевых примесей, сохранность фрагментов и стабильность результатов от партии к партии. Реагенты российского производства Raissol проходят внутренний контроль качества и ориентированы на получение ДНК и РНК, совместимых с qPCR, стандартной ПЦР и подготовкой NGS-библиотек.
Особенно важно это для сложных образцов. Например, при работе с FFPE материалом набор FFPE MAG обеспечивает мягкую депарафинизацию и эффективный реверс кросслинков без агрессивных условий, что выгодно отличает его от универсальных импортных решений, не адаптированных под такие задачи.
Для РНК критично отсутствие РНКаз и минимизация времени обработки. Специализированные наборы Raissol для экстракции РНК ориентированы на сохранение целостности молекул, что важно для транскриптомных исследований и RT-PCR.
Критерий 4. Совместимость с downstream методами и платформами
Выделение нуклеиновых кислот — это только первый этап рабочего процесса. Поэтому важно заранее оценить, насколько полученная ДНК или РНК будет совместима с последующими методами. Для ПЦР важна чистота и отсутствие ингибиторов. Для NGS — сохранность фрагментов, корректная концентрация и воспроизводимость.
Реагенты российского производства Raissol разрабатываются с учетом этих требований. Наборы для выделения ДНК из крови и тканей демонстрируют стабильную совместимость с библиотечными наборами и ферментами для амплификации. Это снижает риски при внедрении реагентов в уже существующие протоколы лаборатории.
В отличие от некоторых импортных решений, требующих строгого следования фирменным протоколам, отечественные наборы более гибки и легко интегрируются в различные рабочие схемы. Это особенно ценно для научных лабораторий, где часто используются модифицированные методики и нестандартные условия экспериментов.
Критерий 5. Стабильность поставок, поддержка и экономическая эффективность
Последний, но не менее важный критерий — доступность реагентов и поддержка со стороны производителя. За последние годы многие лаборатории столкнулись с перебоями в поставках импортных наборов, ростом цен и отсутствием технической поддержки.
Реагенты российского производства Raissol полностью производятся и поставляются внутри страны, что обеспечивает стабильное наличие на складе и прогнозируемую стоимость. Это особенно важно для клинических и диагностических лабораторий, где простои недопустимы.
Дополнительным преимуществом является техническая поддержка на русском языке и возможность подбора оптимального набора под конкретную задачу. Для лабораторий, работающих с ограниченными бюджетами, важна и экономическая эффективность: стоимость одной экстракции при использовании отечественных реагентов зачастую ниже, чем у импортных аналогов, без потери качества.
Таким образом, при выборе набора для выделения ДНК и РНК необходимо учитывать не только технические характеристики, но и логистику, сервис и долгосрочную устойчивость поставщика. Комплексный подход позволяет снизить риски, повысить воспроизводимость и оптимизировать затраты лаборатории.
Выбор набора для выделения ДНК или РНК всегда начинается с анализа исходного материала. Кровь, ткани, клетки, FFPE-блоки, мазки, микробные культуры, растения и фекалии принципиально отличаются по составу, уровню ингибиторов и степени деградации нуклеиновых кислот. Универсальных решений не существует, и попытка использовать один набор для всех типов образцов часто приводит к низкому выходу или плохой воспроизводимости.
Для работы с цельной кровью и плазмой оптимальны специализированные наборы, учитывающие наличие гемоглобина и других ингибиторов. В линейке реагенты российского производства Raissol представлены решения Blood и Blood Quick, рассчитанные на рутинные клинические и научные задачи, а также Blood Mito, ориентированный на выделение митохондриальной ДНК. Такие наборы обеспечивают стабильный выход и чистоту ДНК, пригодную для ПЦР и NGS.
Тканевые образцы требуют более жесткого лизиса и эффективного удаления белков и липидов. Для этого используются наборы Tissue и Tissue M. Первый вариант подходит для ручной работы со спин-колонками, второй — для магнитного метода и масштабируемых протоколов.
Для формалин-фиксированных и парафиновых образцов необходимы специализированные реагенты, так как стандартные протоколы не справляются с кросслинками и деградацией ДНК. Набор FFPE MAG учитывает эти особенности и позволяет получать ДНК, пригодную для амплификации и секвенирования.
Для микробиологических и аграрных лабораторий критичны наборы для бактерий, дрожжей, растений и сложных матриц. Реагенты российского производства Raissol включают решения для Microbe DNA, Plant DNA, Feces DNA и Bone DNA, что позволяет подобрать протокол под конкретную задачу без компромиссов по качеству.
Критерий 2. Метод выделения: спин-колонки или магнитные частицы
Второй ключевой фактор — технология экстракции. На практике используются два основных подхода: сорбция на кремниевых спин-колонках и сорбция на магнитных частицах. Каждый метод имеет свои сильные стороны и ограничения.
Спин-колонки остаются популярным решением для небольших объемов и ручной работы. Они не требуют дополнительного оборудования, легко осваиваются персоналом и подходят для лабораторий с невысокой загрузкой. Наборы Tissue, Blood и Microbe DNA относятся именно к этой категории. Их выбирают, когда важны простота, скорость и минимальные требования к оснащению.
Магнитные частицы обеспечивают большую гибкость. Они удобны при работе с большим количеством образцов, легко автоматизируются и снижают влияние человеческого фактора. Реагенты российского производства Raissol в формате Tissue M, FFPE MAG и Blood Mito позволяют выстраивать масштабируемые протоколы, совместимые с автоматическими станциями. Это особенно важно для диагностических центров и крупных научных лабораторий.
По сравнению с импортными аналогами Qiagen или Thermo Fisher, магнитные наборы отечественного производства выигрывают по доступности и стабильности поставок, при сопоставимых показателях чистоты и выхода нуклеиновых кислот.
Критерий 3. Качество, чистота и выход нуклеиновых кислот
Качество выделенной ДНК или РНК напрямую определяет успех последующих этапов анализа. Наличие ингибиторов, деградация или низкий выход приводят к провалам ПЦР, неравномерному покрытию при секвенировании и повторным переработкам образцов.
При выборе набора необходимо учитывать несколько параметров: соотношение A260/280, отсутствие белковых и солевых примесей, сохранность фрагментов и стабильность результатов от партии к партии. Реагенты российского производства Raissol проходят внутренний контроль качества и ориентированы на получение ДНК и РНК, совместимых с qPCR, стандартной ПЦР и подготовкой NGS-библиотек.
Особенно важно это для сложных образцов. Например, при работе с FFPE материалом набор FFPE MAG обеспечивает мягкую депарафинизацию и эффективный реверс кросслинков без агрессивных условий, что выгодно отличает его от универсальных импортных решений, не адаптированных под такие задачи.
Для РНК критично отсутствие РНКаз и минимизация времени обработки. Специализированные наборы Raissol для экстракции РНК ориентированы на сохранение целостности молекул, что важно для транскриптомных исследований и RT-PCR.
Критерий 4. Совместимость с downstream методами и платформами
Выделение нуклеиновых кислот — это только первый этап рабочего процесса. Поэтому важно заранее оценить, насколько полученная ДНК или РНК будет совместима с последующими методами. Для ПЦР важна чистота и отсутствие ингибиторов. Для NGS — сохранность фрагментов, корректная концентрация и воспроизводимость.
Реагенты российского производства Raissol разрабатываются с учетом этих требований. Наборы для выделения ДНК из крови и тканей демонстрируют стабильную совместимость с библиотечными наборами и ферментами для амплификации. Это снижает риски при внедрении реагентов в уже существующие протоколы лаборатории.
В отличие от некоторых импортных решений, требующих строгого следования фирменным протоколам, отечественные наборы более гибки и легко интегрируются в различные рабочие схемы. Это особенно ценно для научных лабораторий, где часто используются модифицированные методики и нестандартные условия экспериментов.
Критерий 5. Стабильность поставок, поддержка и экономическая эффективность
Последний, но не менее важный критерий — доступность реагентов и поддержка со стороны производителя. За последние годы многие лаборатории столкнулись с перебоями в поставках импортных наборов, ростом цен и отсутствием технической поддержки.
Реагенты российского производства Raissol полностью производятся и поставляются внутри страны, что обеспечивает стабильное наличие на складе и прогнозируемую стоимость. Это особенно важно для клинических и диагностических лабораторий, где простои недопустимы.
Дополнительным преимуществом является техническая поддержка на русском языке и возможность подбора оптимального набора под конкретную задачу. Для лабораторий, работающих с ограниченными бюджетами, важна и экономическая эффективность: стоимость одной экстракции при использовании отечественных реагентов зачастую ниже, чем у импортных аналогов, без потери качества.
Таким образом, при выборе набора для выделения ДНК и РНК необходимо учитывать не только технические характеристики, но и логистику, сервис и долгосрочную устойчивость поставщика. Комплексный подход позволяет снизить риски, повысить воспроизводимость и оптимизировать затраты лаборатории.