ОСНАЩЕНИЕ И УСЛУГИ ДЛЯ НАУЧНЫХ ЛАБОРАТОРИЙ
Html code will be here
Полногеномное бисульфитное секвенирование (Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)
Полногеномное бисульфитное секвенирование (Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS) — это метод, позволяющий определить уровень метилирования цитозинов по всему геному с высокой точностью. В процессе анализа ДНК подвергается обработке бисульфитом, который превращает незрелые цитозины в урацилы, а метилированные цитозины остаются без изменений. После этого проводится секвенирование, позволяющее выявить метилированные участки по сравнению с исходной последовательностью.
Зачем проводят WGBS?
Зачем проводят WGBS?
- Исследование эпигенетических механизмов: Анализ метилирования помогает понять регуляцию генов и их экспрессию в различных условиях и состояниях.
- Диагностика и профилактика заболеваний: Обнаружение изменений в метилировании связано с раком, неврологическими расстройствами, аутоиммунными заболеваниями и другими патологиями.
- Изучение развития и дифференцировки клеток: Метилирование играет ключевую роль в эмбриональном развитии и дифференцировке тканей.
- Персонализированная медицина: Помогает определить эпигенетические маркеры для индивидуальных подходов к лечению.
- Биологические исследования: Используется для изучения эволюции, адаптации и взаимодействия организмов с окружающей средой.
Наши услуги включают:
- Полногеномное бисульфитное секвенирование для различных образцов
- Анализ уровня метилирования по всему геному
- Интеграцию данных с другими «омическими» данными для комплексных исследований
Полногеномное бисульфитное секвенирование является одним из методов, используемых для анализа эпигенетических модификаций на уровне цитозиновых оснований в геноме. Эта технология была разработана для исследования метилирования ДНК, которое играет важную роль в регуляции генной активности и может быть связано с различными аспектами жизни и здоровья.
В полногеномном бисульфитном секвенировании используется химическая модификация ДНК с помощью бисульфита. Бисульфит преобразует все неметилированные цитозины в урацилы, в то время как метилированные цитозины сохраняются. После этого следует серия реакций, амплификации и последующего секвенирования, обеспечивающих получение последовательности ДНК.
Главной особенностью полногеномного бисульфитного секвенирования является возможность анализировать метилирование на одиночном основании в геноме. Это позволяет получить информацию о точности и положении метилированных и неметилированных сайтов в геноме.
Для достижения высокой точности и надежности результатов необходимо применять современные системы секвенирования нового поколения, основанные, например, на технологии иллюмины. Эти системы позволяют быстро и достаточно точно определить последовательность ДНК.
При полногеномном бисульфитном секвенировании обычно используется ряд праймеров, специально разработанных для амплификации участков интереса в геноме. Для получения полного набора данных по каждому образцу необходимо провести несколько реакций амплификации.
Полученные после секвенирования данные анализируются начиная с регистрации сигналов, полученных на каждом из положений оснований. Затем происходит преобразование этих сигналов в последовательность ДНК, которая дает информацию о метилировании каждого цитозина в геноме.
Однако следует отметить, что полногеномное бисульфитное секвенирование имеет свои ограничения. Размер фрагментов ДНК, которые можно успешно амплифицировать, ограничен, поэтому для анализа больших участков генома может потребоваться дальнейшая обработка.
Более того, данная методика требует использования специального оборудования и хорошо оборудованной лаборатории. Вместе с тем, полногеномное бисульфитное секвенирование представляет мощный инструмент для исследования эпигенетических модификаций и может помочь в раскрытии общих принципов и молекулярных механизмов, лежащих в основе различных биологических процессов и патологий.
В полногеномном бисульфитном секвенировании используется химическая модификация ДНК с помощью бисульфита. Бисульфит преобразует все неметилированные цитозины в урацилы, в то время как метилированные цитозины сохраняются. После этого следует серия реакций, амплификации и последующего секвенирования, обеспечивающих получение последовательности ДНК.
Главной особенностью полногеномного бисульфитного секвенирования является возможность анализировать метилирование на одиночном основании в геноме. Это позволяет получить информацию о точности и положении метилированных и неметилированных сайтов в геноме.
Для достижения высокой точности и надежности результатов необходимо применять современные системы секвенирования нового поколения, основанные, например, на технологии иллюмины. Эти системы позволяют быстро и достаточно точно определить последовательность ДНК.
При полногеномном бисульфитном секвенировании обычно используется ряд праймеров, специально разработанных для амплификации участков интереса в геноме. Для получения полного набора данных по каждому образцу необходимо провести несколько реакций амплификации.
Полученные после секвенирования данные анализируются начиная с регистрации сигналов, полученных на каждом из положений оснований. Затем происходит преобразование этих сигналов в последовательность ДНК, которая дает информацию о метилировании каждого цитозина в геноме.
Однако следует отметить, что полногеномное бисульфитное секвенирование имеет свои ограничения. Размер фрагментов ДНК, которые можно успешно амплифицировать, ограничен, поэтому для анализа больших участков генома может потребоваться дальнейшая обработка.
Более того, данная методика требует использования специального оборудования и хорошо оборудованной лаборатории. Вместе с тем, полногеномное бисульфитное секвенирование представляет мощный инструмент для исследования эпигенетических модификаций и может помочь в раскрытии общих принципов и молекулярных механизмов, лежащих в основе различных биологических процессов и патологий.