Cеквенирование транскриптома в лаборатории Сесана

Секвенирование транскриптома

Экспертный RNA-seq для сложных исследовательских задач

Раскройте полный потенциал ваших образцов с помощью профессионального RNA-seq.
Мы специализируемся на комплексных решениях, адаптированных под специфику вашего проекта:
от дизайна эксперимента до публикационной интерпретации данных.

ПОЛУЧИТЬ КП ЗАПРОСИТЬ УСЛОВИЯ

Полный спектр протоколов

Bulk RNA-seq

Стандартный, stranded (направленный), low-input/degraded RNA, total RNA, polyA-selected. Референсные глубины секвенирования.
Анализ изоформ (Isoform Analysis)

Полнотранскриптомное секвенирование (Iso-Seq, long-read) для детекции альтернативного сплайсинга, слияний, новых транскриптов.
Одноклеточное / одноядерное секвенирование (scRNA-seq / snRNA-seq)

Полноценный цикл работ – от подготовки суспензий до сложнейшего анализа гетерогенности клеточных популяций.

Не просто данные. Решаем научные вопросы.

Продвинутый анализ

Глубокое дифференциальное выражение (DEA), анализ альтернативного сплайсинга (Differential Alternative Splicing), анализ обогащения генных путей (GSEA, ORA), построение сетей ко-экспрессии и взаимодействий генов (WGCNA и др.), интеграция с другими омиксными данными (мультиомика).
Гибкая аналитика

Разработка кастомных скриптов под ваши уникальные гипотезы. Поддержка de novo сборки транскриптома для немодельных организмов.

Что мы предоставляем?

Подготовку и секвенирование библиотек для RNA-Seq на современных платформах
Передачу сырых данных в формате FASTQ, готовых к дальнейшему анализу

Обратитесь к нам для обсуждения ваших требований — мы готовы помочь с комплексным анализом или предоставить только исходные данные.

Ключевые преимущества для вас

Глубина вместо шаблонности

Решаем сложные задачи, а не предлагаем стандартные пакеты.
Фокус на интерпретации

Превращаем терабайты данных в понятные биологические инсайты.
Гибкость и экспертиза

Работаем с нишевыми протоколами и немодельными объектами.
Полный цикл – единая ответственность

От образца до готового анализа в одних руках.

Партнерство на всех этапах

Консультация по дизайну эксперимента

Оптимизируем подход под ваш бюджет и научные вопросы.
Контроль качества на каждом шаге

От RNA Integrity Number (RIN) до финальных отчетов.
Интерпретация и визуализация

Ясные, публикационно-готовые результаты (PCA, Volcano plots, UMAP/t-SNE, пространственные карты, интерактивные отчеты).
Поддержка публикации

Предоставление данных в требуемых форматах, помощь в описании методов.

Получить КП

Полезные материалы

Saturday, September 20

Что представляет собой секвенирование транскриптома

Роль секвенирования в науке и медицине с каждым годом только растет. Уже сложно представить генетическую лабораторию без секвенатора. Его используют для проведения фундаментальных исследований, например, расшифровки генома любого из живущих на планете видов. Также, прикладные задачи секвенирования включают в себя диагностику патологий, определение особенностей раковых опухолей, селекции и многого другого. Так какие же разновидности секвенирования существуют в настоящее время и для чего они используются?

Tuesday, July 18

Основные приложения секвенирования в науке и медицине

Роль секвенирования в науке и медицине с каждым годом только растет. Уже сложно представить генетическую лабораторию без секвенатора. Его используют для проведения фундаментальных исследований, например, расшифровки генома любого из живущих на планете видов. Также, прикладные задачи секвенирования включают в себя диагностику патологий, определение особенностей раковых опухолей, селекции и многого другого. Так какие же разновидности секвенирования существуют в настоящее время и для чего они используются?

Tuesday, June 27

Как проходит подготовка библиотеки для секвенирования?

Совершенствование технологии секвенирования привело к уменьшению затрат и повышению качества, а также расширению спектра применения метода. В этой статье мы рассмотрим значение подготовки высококачественных библиотек для NGS, а также влияние таких факторов, как количество и качество исходного материала ДНК и РНК.

Monday, June 12

Обзор методов секвенирования

За десятилетия, прошедшие с разработки первого метода по секвенированию нуклеиновых кислот, метод по-настоящему эволюционировал в руках умелых исследователей. Одной из самых интересных и значимых глав в истории секвенирования стал проект "Геном человека", который привел к экспоненциальному росту интереса к методике, а значит ее развитию и скорой коммерсанализации. Пионером среди методов стало секвенирование по Сэнгеру, так называемый "золотой стандарт", но по мере развития появилась необходимость в более быстрых и экономичных способах анализа.