Oxford Nanopore — секвенирование длинными чтениями

Ключевые преимущества:

• Прочтения, ограниченные лишь длиной молекул геномной ДНК — полная детекция структурных вариаций и повторов.
• Прямой анализ: детекция модификаций ДНК и РНК без бисульфитной конверсии. 
• Секвенирование ампликонов и плазмид без необходимости фрагментации.
• Полное секвенирование всех регионов гена 16S рРНК.

Идеально для:

• Сложная геномика: геномные сборки de novo, гибридное секвенирование, эпигенетический анализ.
• Метагеномика: профилирование по 16S или ITS1-5.8S-ITS2 регионам, а также сборка MAG.
• Эпигенетика: анализ паттернов метилирования напрямую.

Технические детали:

• Секвенирование на ячейках последней версии R10.4.1 с проведением самого точного бейсколлинга SUP.
• Секвенирование пулов размером до 96 образцов.
• Выгрузка данных в формате FASTQ на защищенный сервер.