В формировании атеросклеротических бляшек участвуют несколько типов клеток: иммунные, гладкомышечные и эндотелиальные, выстилающие артерии. Многие из них переходят в другие типы клеток во время образования бляшек, что затрудняет определение их происхождения. Врачи и ученые активно изучают процесс образования бляшек в сосудах, чтобы найти способ избежать этого процесса.
В целях разработки эффективных методов лечения, исследователи из University of Virginia создали атлас атеросклероза. Благодаря нему ученые смогут изучать на уровне отдельных клеток процессы, связанные с разными патологиями. Например, такими как инсульт и ишемическая болезнь сердца. Результаты опубликованы в журнале Cell Reports.
Ученые использовали секвенирование РНК одиночных клеток (scRNA-seq). Данный метод направлен на получение сведений о транскриптоме, специфичном для клеток определенного фенотипа. Исследователи провели комплексный метаанализ 22 библиотек scRNA-seq для 118 578 отдельных клеток.
Ученые интегрируют полученные данные по ассоциациям для всего генома в целях выяснить причины развития инфаркта миокарда, коронарной кальцификации и других патологических процессов. В результате ученым удалось выявить такие биомаркеры, специфичные для клеток сердца и сосудов, как LTBP1 и CRTAC1. Они могут выступать показателями прогрессирования атеросклероза.
Исследование также дает новое представление об изменениях, которые происходят в гладкомышечных клетках во время прогрессирования заболевания, некоторые из которых способствуют кальцификации коронарных артерий. Создание атласа клеток поможет в разработке стратегии перепрограммирования нарушения состояния клеток, позволяющего обратить болезнь вспять. Также, подобные данные ускорят процесс обнаружения биомаркеров для оценки риска возникновения патологии.
Ученые планируют расширить этот одноклеточный атлас будущими итерациями, включив в него дополнительные наборы данных по определенным стадиям заболевания и пациентам. Такой подход позволит установить более надежные механизмы потенциальных заболеваний.
В целях разработки эффективных методов лечения, исследователи из University of Virginia создали атлас атеросклероза. Благодаря нему ученые смогут изучать на уровне отдельных клеток процессы, связанные с разными патологиями. Например, такими как инсульт и ишемическая болезнь сердца. Результаты опубликованы в журнале Cell Reports.
Ученые использовали секвенирование РНК одиночных клеток (scRNA-seq). Данный метод направлен на получение сведений о транскриптоме, специфичном для клеток определенного фенотипа. Исследователи провели комплексный метаанализ 22 библиотек scRNA-seq для 118 578 отдельных клеток.
Ученые интегрируют полученные данные по ассоциациям для всего генома в целях выяснить причины развития инфаркта миокарда, коронарной кальцификации и других патологических процессов. В результате ученым удалось выявить такие биомаркеры, специфичные для клеток сердца и сосудов, как LTBP1 и CRTAC1. Они могут выступать показателями прогрессирования атеросклероза.
Исследование также дает новое представление об изменениях, которые происходят в гладкомышечных клетках во время прогрессирования заболевания, некоторые из которых способствуют кальцификации коронарных артерий. Создание атласа клеток поможет в разработке стратегии перепрограммирования нарушения состояния клеток, позволяющего обратить болезнь вспять. Также, подобные данные ускорят процесс обнаружения биомаркеров для оценки риска возникновения патологии.
Ученые планируют расширить этот одноклеточный атлас будущими итерациями, включив в него дополнительные наборы данных по определенным стадиям заболевания и пациентам. Такой подход позволит установить более надежные механизмы потенциальных заболеваний.
