Top.Mail.Ru
К основному контенту
 
ОСНАЩЕНИЕ И УСЛУГИ ДЛЯ НАУЧНЫХ ЛАБОРАТОРИЙ
Telegram

SURFSeq 5000

Высокопроизводительная платформа для полногеномного секвенирования
Получить КП
SURFSeq 5000
Компания Sesana представляет SURFSeq 5000 — высокопроизводительный прибор для полногеномного секвенирования от надежного производителя "GeneMind".

Все протоколы пробоподготовки библиотек, используемые на приборах Illumina, уже адаптированы под SURFSeq 5000.

Секвенатор имеет широкий спектр применения. Подходит как для средних, так и для крупных лабораторий.
Мультизадачный
2 независимые ячейки с возможностью ручной загрузки библиотек


Полногеномный
8 геномов человека за запуск
Непрерывный
Запуск новой ячейки до завершения первого запуска


Гибкий
Возможность выбирать количество циклов секвенирования до выдачи данных
Рабочие параметры SURFSeq 5000
SURFSeq5000
  • 8 геномов человека за запуск
  • 2 независимых проточных ячейки
  • Запуск новой ячейки до завершения первого запуска
  • Ручная и автоматическая загрузка библиотек
  • Автоматическая промывка
  • Производительный и быстрый: 1200 Гб за 48 часов
  • До 4000M прочтений за запуск
Технические характеристики
ЯчейкаКоличество дорожекКоличество прочтенийТипДлина прочтенийКоличество данных (FCx2)Q30Время анализа
FCM 4 500 M 100 циклов SE100 50 Гб×2 ≥85% 12 ч
PE50 50 Гб×2 ≥90% 12 ч
200 циклов PE100 100 Гб×2 ≥85% 18 ч
300 циклов PE150 150 Гб×2 ≥85% 24 ч
FCH 4 2000 M 50 циклов SE50 100 Гб×2 ≥90% 14 ч
100 циклов PE50 200 Гб×2 ≥90% 21 ч
200 циклов PE100 400 Гб×2 ≥85% 34 ч
300 циклов PE150 600 Гб×2 ≥85% 47 ч
В основе работы прибора лежит принцип секвенирования путём синтеза:
Готовятся библиотеки с адаптерами комплементарными поверхности ячейки для секвенирования.
Связанные с ячейкой библиотеки амплифицируются в моноклональных кластерах.
Далее библиотеки секвенируются за счет обратимой терминации и флуоресцентно меченых нуклеотидов.

SURF-seqTM - Секвенирование осуществляется с использованием четырех меченых разными флуорофорами нуклеотидов, 3′-конец которых заблокирован (обратимые терминаторы).

Каждая ячейка может быть загружена независимо от второй, поэтому две дорожки на картридже могут работать параллельно с разными образцами или типами секвенирования, что позволяет сократить время работы прибора и расширить сферы его применения в рамках одного эксперимента.
Области применения
ПримененияДанные/образецКоличество образцов, шт.
Полный геном 120Гб/образец 2-8
Полный экзом 10Гб/образец 24-100
Таргетные панели (средние) 5Гб/образец 50-200
Таргетные панели (большие) 10Гб/образец 24-100
Транскриптом 10Гб/образец 24-100
Single cell 60Гб/образец 4-16
Спецификация
Габаритные размеры 1090 мм (Д)*690 мм (Ш)*810 мм (В)
Масса 240 кг
Требования к электричеству 100-240 В переменного тока ± 10 % (50/60 Гц)
Потребляемая мощность 2000W
Температура 19-25℃
Влажность (относительная) 20-85% (без конденсации)
Сравнение с основными платформами для секвенирования
Genemind BGI Tech Illumina
SURFSeq 5000
FASTASeq300
Genolab M
DNBSeq-G99
DNBSEQ-G400
MiSeqNextSeq 550NextSeq 2000
Амплификация Технология поверхностной амплификации HyEnd Мостиковая ПЦР Мостиковая ПЦР Амплификация по типу катящегося кольца Амплификация по типу катящегося кольца Мостиковая ПЦР Мостиковая ПЦР Мостиковая ПЦР
Метод Секвенирование путем синтеза Секвенирование путем синтеза Секвенирование путем синтеза Секвенирование путем синтеза Секвенирование путем синтеза Секвенирование путем синтеза Секвенирование путем синтеза Секвенирование путем синтеза
Применения Полный геном, НИПТ/ПГТ, Таргетное секвенирование, Полный экзом, Транскриптом, Метагеном НИПТ/ПГТ, Таргетное секвенирование, Полный экзом, Малые геномы, Транскриптом, Метагеном НИПТ/ПГТ, Таргетное секвенирование, Полный геном, Полный экзом, Транскриптом, Метагеном НИПТ/ПГТ, Таргетное секвенирование, Малые геномы, Полный экзом НИПТ/ПГТ, Таргетное секвенирование, Полный геном, Полный экзом Таргетное секвенирование, Транскриптом, Метагеном НИПТ/ПГТ, Таргетное секвенирование, Полный геном, Полный экзом, Транскриптом НИПТ/ПГТ, Таргетное секвенирование, Полный геном, Полный экзом, Транскриптом, Метагеном
Рабочее время до 48 часов до 24 часов до 53 часов до 30 часов до 107 часов до 56 часов до 29 часов до 48 часов
Количество ячеек 2 1 2 2 2 1 1 1
Количество независимых дорожек в ячейке 4 4 1 1 2/4 1 1 1
Длины прочтений SE100, SE150, PE50, PE100, PE150 SE50, SE75, PE75, SE150, PE150 SE75, SE150, PE75, PE150 SE100, PE50, PE100, PE150 SE50, SE100, PE100, PE150 SE36, PE25, PE75, PE150, PE250, PE300 SE75, PE75, PE150 SE50, PE50, PE100, PE150, PE300
Максимальное количество ридов за запуск 2000M 250 M 1000 M 500 M 3600 M 22 M 400 М 1200 M
Максимальное количество данных за запуск 1200 Gb 75 Gb 300 Gb 48 Gb 1,2 Tb 13,2 Gb 120 Gb 360 Gb
Кол-во флуорофоров в химии 4 4 4 4 4 4 2 2
Автоматическая промывка да да нет да нет нет да полностью сухая работа
Параллельная загрузка ячеек да нет да да нет нет нет нет
Впервые на рынке NGS — появилась функция 6 вариантов генерации данных FastQ в реальном времени! Данная инноваций предоставляет возможность вывода 6 файлов FastQ в процессе секвенирования для быстрого анализа. Это обеспечивает большую гибкость по сравнению со схожими устройствами от других производителей.

Новый подход в секвенировании - параллельный запуск ячеек! Если во время секвенирования первой проточной ячейки у вас появляется еще одна партия образцов, готовых к секвенированию, то нет необходимости ждать! Легко установите вторую ячейку и начните секвенирование, пока первый этап еще продолжается. Этот процесс — то, что мы называем "паралельный запуск", задает новый стандарт для эффективного рабочего процесса секвенирования.