Протеомика изучает белки, их структуру и функции. В мультиомных исследованиях совмещение данных геномики, транскриптомики и протеомики помогает получить комплексное понимание биологических процессов. Методика протеомики Olink, реализуемая в лаборатории «Сесана», дополняет результаты секвенирования следующего поколения (NGS), обеспечивая дополнительный слой данных для анализа. Подробности протеомики Olink доступны на целевой странице.
Основные особенности протеомики Olink
Olink Signature позволяет анализировать тысячи белков в микролитровом объёме образца, что актуально для системных и когортных исследований. Такой масштаб важен для интеграции с данными NGS и другими омными платформами.
Платформа Olink Signature Q100
Технология Proximity Extension Assay (PEA) обеспечивает высокую чувствительность и специфичность измерений. Детекция сигнала выполняется методами qPCR или NGS, что гарантирует воспроизводимость по повторным замерам и между лабораториями. Данная платформа подходит для лабораторий с соответствующей аналитической инфраструктурой и квалификацией персонала.
Панели Explore и Reveal
Панели Explore предназначены для измерения до 5372 белков из нескольких микролитров образца, что расширяет возможности поиска биомаркеров и способствует многомерной интеграции. Панель Reveal охватывает около 1000 белков и требует меньших ресурсов, поэтому подходит для проектов раннего скрининга или валидации, где важно быстро получить качественные данные при умеренных требованиях к оборудованию.
Взаимодополнение протеомики Olink и NGS
Интеграция данных протеомики и NGS позволяет не только выявлять геномные варианты, но и оценивать их функциональное влияние на экспрессию белков и связанные клеточные процессы. Такая многослойная аналитика способствует получению более полного профиля биологических изменений.
Управление качеством и воспроизводимость
Olink внедряет стандарты контроля качества, обеспечивающие воспроизводимость с межлабораторной вариабельностью менее 5%. Это важно для сопоставимости результатов между проектами и повышения уверенности в данных. Контроль включает проверку целостности образцов, стандарты репликации и внутренние калибровочные процедуры.
Ограничения метода
Требуется достаточный объём образца, который должен храниться при низкой температуре для сохранения стабильности белков. Чувствительность различных белков варьируется, что влияет на полноту и интерпретацию профиля. Необходимо учитывать специфику подготовки проб и влияние преданалитических факторов на результаты анализа.
Заключение
Протеомика Olink дополняет данные NGS в мультиомных проектах, предоставляя детальную информацию о белковых изменениях. Использование технологии PEA обеспечивает чувствительные и воспроизводимые измерения, способствующие более точному пониманию биологических механизмов. Дополнительные материалы доступны на целевой странице.
FAQ
- Что такое протеомика Olink?
Метод анализа белков, позволяющий одновременно измерять тысячи белков из микролитрового объёма с помощью технологии Proximity Extension Assay (PEA). - Как протеомика Olink дополняет NGS?
Обеспечивает функциональную информацию о белках, что помогает интерпретировать геномные данные, выявленные с помощью секвенирования. - Какие преимущества у платформы Olink Signature Q100?
Высокая чувствительность, специфичность и воспроизводимость, а также возможность анализировать большой набор белков из малого объёма образца. - Какие ограничения метода протеомики Olink?
Требования к объёму и условиям хранения образца, варьирующаяся чувствительность по белкам, влияние преданалитических факторов. - Как обеспечивается контроль качества в исследованиях Olink?
Строгие стандарты, межлабораторная вариабельность менее 5%, внутренние калибровки и проверка целостности проб.